Отопление церкви без нарушения её внутреннего убранства чужеродными предметами (как, например, радиаторами и т.п.) на сегодняшний день легко осуществимо. Площадь Эртильской церкви около 320 м2, высота от 2,6 до 12,9 м. Общий объём отапливаемых помещений 3300 м3.  Отопление таких объёмных помещений наиболее рационально осуществлять тёплым воздухом. Система отопления церкви выполнена на 4-х канальных газовых воздухонагревателях Rheem SGPN-13 полезной мощностью 32 кВт каждый. Оборудование установлено в подвале. Воздуховоды проложены под потолком подвального помещения. Подача воздуха осуществляется из решёток в полу. Забор воздуха осуществляется частично с пола и частично через стену. Для вентилирования в верхней части установлен вытяжной вентилятор. Вентиляция организована с помощью частичного подмеса свежего воздуха с улицы в обратный канал воздухонагревателей, и работает совместно с вытяжным вентилятором, удаляющим воздух из помещения. Такой подход обеспечивает необходимый воздухообмен для предотвращения образования конденсата, который может негативно влиять на роспись стен и свода. Рециркуляция в системе отопления церкви позволяет фильтровать воздух от пыли и копоти. Фильтрующие элементы стоят на входе каждого воздухонагревателя. Управление системой осуществляется автоматически, поддерживая заданное значение температуры, устанавливаемое на электронном термостате. Возможно программирование системы и разделение суток на несколько интервалов с различной температурой (до 4-х, напрмер, утро, день, вечер, ночь), чтобы сократить расход топлива.
В перспективе планируется установить на систему кондиционеры для охлаждения воздуха.